Enero de 2018
Elaboración de un trabajo corto: memoria breve, informe, artículo.
Librerías de R complementarias: templates en la librería rticles
.
Objetivos
Desarrollaremos un proyecto de un trabajo tipo artículo para analizar el método de trabajo y de organización de la información en ficheros.
Utilizaremos las "plantillas" o templates de documentos para presentar nuestro trabajo con el aspecto de un artículo de revista, analizando —someramente— los requerimientos de las editoriales para la remisión de trabajos.
Bibliografía: ficheros, formatos y estilos, referencias y citas
Captura de la información de referencias en la red
Objetivos
Instalación de y configuración pandoc
pandoc
: conversión de documentos docx
a formato rmarkdown.
Objetivo
En la sesión anterior planteamos una serie de ejercicio con distintos documentos.
Descarga desde este enlace estarán disponibles las soluciones a partir del próximo jueves, 25 de enero.
Descargate este ejemplo.
Análisis de los distintos elementos utilzados
Extracción de partes a ficheros independientes: los chunks son nuestros amigos
``` {r}
# Código de R
```
Un chunk muy interesante
``` {r, child='resultados.Rmd', eval=FALSE}
# Texto correspondiente al apartado de resultados
```
rticles
Esta libería proporciona plantillas para praparar trabajos destinados a distintas revistas: Royal Society Open Science, R Journal, Elsevier journals, …
Desde el menú de Rstudio elegímos:
Tools
\(\rightarrow\) Install packages
\(\rightarrow\)
En el item Packages
escribimos rticles
Comprobamos que disponemos de estos templates como opción al crear un nuevo documento Rmarkdown.
Herramienta para dar formato a referencias documentales (wikipedia).
Manejo de bibliografía con , para ver los tipos de referencias (wikibooks).
JabRef es un Software de gestión bibliográfica que utiliza BibTeX como formato nativo (wikipedia).
Un vídeo para iniciarse.
Un manual breve
pandoc
Consideraremos al instalación en sistemas windows
Descargar el fichero de instalación de la página de desarrollo del proyecto, en la entrada de descargas: pandoc-2.1.1-windows.msi
path
(1/2)Configuración para acceder a programa desde cualquier directorio
Trabajaremos en una terminal de Rstudio o desde el símbolo del sistema
Necesitamos incluir en el path
por defecto el correspondiente a pandoc
.
El programa se ha instalado en nuestro home directory
~\AppData\Local\Pandoc\
c:\Users\fenix\AppData\Local\Pandoc\
path
actual no incluye pandoc
, para verlo:echo %path%
path
(2/2)Añadimos el directorio de pandoc
al path
actual:
set PATH=%path%;C:\Users\fenix\AppData\Local\Pandoc\
Comprobamos utilizando nuevamente:
echo %path%
fenix
por el alias del usuario que hace la instalación.pandoc
: conversión de documentosDescarga este fichero de trabajo con formato docx
Guárdalo en el escritorio, con el nombre plantillaOrig.docx
Desde el símbolo del sistema o una terminal de Rstudio, cambia el directorio de trabajo al escritorio (~/Desktop
)
Crea un nuevo fichero con formato:
pandoc plantillaOrig.docx -o plantilla.md
alternativamente, indicando el marcado de salida:
pandoc plantillaOrig.docx -t markdown -o plantilla.Rmd